최근 위장관, 피부, 구강 등의 인체 미생물과 인간의 건강 및 질병간의 연관성이 밝혀지면서, 미생물을 질병 예방이나 진단 및 치료 등의 맞춤의료에 활용하고자 메타지놈연구가 활발히 진행되고 있다. 대용량 시퀀싱 기술의 발달은 기존 배양 기반의 미생물연구에 혁신적인 발전을 가져왔으며, 이렇게 얻어진 메타지놈 자료는 인간 유전체자료 분석과 마찬가지로 생물정보학기술이 바탕이 된다. 그러나 인간 유전체자료와 달리, 한가지 종이 아닌 다양한 미생물 군집 데이터를 분석하고 해석 해야하므로, 이를 위해 반드시 알아야 할 기초 지식과 데이터 분석, 그리고 결과의 해석 능력이 필요하다. 본 강좌에서는 메타지놈을 처음 접하는 초보자에게, 관련 논문을 읽고 이해할 수 있을 정도의 기초이론에 대한 상세한 개념 설명 뿐만 아니라, 16S rRNA gene의 amplicon sequencing 에 기반-집중하여, 실제 연구디자인 및 시퀀싱 raw 데이터부터 미생물 군집분석까지 QIIME2 프로그램으로 직접 실습으로 진행해봄으로써 실제 연구에 바로 활용 가능하도록 한다.
본 강의를 통하여 수강생들은 다음과 같은 기술을 익힐 수 있다.
(메타지놈 연구 디자인과 기본 개념 / Marker gene (16S rRNA gene amplicon) 시퀀스 데이터의 퀄리티 해석 / 16S rRNA gene 시퀀스 raw 데이터(fastq)로부터 미생물의 feature table 생성 / 미생물의 다양성 (a-diversity, ß-diversity) 및 taxonomic profile 분석 및 결과 해석)