강좌 정보
2023 제17회 통계유전학워크샵
17th Asian Institute in Statistical Genetics and Genomics
기본 개요
강좌명
단일세포 전사체 분석 기술을 이용한 암 연구 (단일세포전사체 응용1)
주강사
이세민(UNIST)
조교
정형오, 장진호 (UNIST)
날짜
2023.07.19 09:20 ~ 2023.07.20 17:10
강좌 방식
오프라인 / 이론+실습
강좌 정보
본 강좌에서는 최근 각광받고 있는 단일세포 전사체 데이터 분석 기술을 이용한 암연구에 대한 소개와 실제 데이터에 대한 분석 실습을 병행하고자 한다. 단일세포 전사체 분석 기술은 암의 진화, 면역세포 프로파일링 및 종양 내 이질성 분석 등에 활용되고 있으며, 관련 기술과 응용 사례에 대한 소개 및 현재 가장 널리 사용되고 있는 10x Genomics사의 Chromium Single Cell Gene Expression Solution을 사용하여 생산된 암조직에 대한 단일세포 전사체 데이터를 위주로 다양한 분석 방법에 대한 실습을 진행하고자 한다.
기타
인터넷 접속 필요여부
웹서핑
동영상
파일 다운로드
기타 (분석서버접속)
교육생 개인 노트북
필요 필요하지 않음
세부 안내사항
인터넷 접속 가능한 랩탑 필요
수강생 수준
Linux 기본 명령문 사용 가능자 또는 생물정보학 입문자
수강생 준비물
노트북
기타 안내사항
-
교육일정
구분 세션 시간 강의내용 강사명 비고
Day 1 Session 1 9:20~10:50 Introduction 이세민 강의
Day 1 Session 2 11:00~12:30 Data processing 이세민 강의
Day 1 Session 3 14:00~15:30 Data analysis 이세민 강의
Day 1 Session 4 15:40~17:10 Data visualization 이세민 강의
Day 2 Session 5 9:20~10:50 Processing scRNA-seq data 정형오, 장진호 실습
Day 2 Session 6 11:00~12:30 Quality check 정형오, 장진호 실습
Day 2 Session 7 14:00~15:30 Biological Analysis 정형오, 장진호 실습
Day 2 Session 8 15:40~17:10 Visualization 정형오, 장진호 실습