본 강좌에서는 암유전체학의 최근 발전 동향 및 주요 주제를 데이터 분석의 측면에서 살펴보고자 한다. 차세대 시퀀싱(NGS) 방법의 도입에 따라 암유전체학은 비약적인 발전을 거듭하여 맞춤의료, 정밀의료의 첨단 분야로 확립되고 있다.
1일차 강의에서는 차세대 시퀀싱 기반의 암유전체학에 대한 소개와 NGS 데이터의 기본적인 분석 방법을 다룰 것이다. 모든 분석의 근간이 되는 whole exome sequencing과 transcriptome sequencing 데이터 분석을 통하여 somatic variants를 찾고 발현 데이터의 처리 및 정량화를 공부한다. 또한 차등발현, 시그니처 유전자 분석 등의 생물학적 해석을 위한 방법론을 소개한다.
2일차 강의는 최근 암 연구의 패러다임을 바꾸고 있는 단일세포 시퀀싱 (공간 전사체 포함), 암 면역치료를 중심으로 실제 임상에서 정밀의료 구현을 위한 환자 상세분류 등의 다양한 주제를 다루고자 한다. 실습은 교육생들이 추후 실제 연구에 활용할 수 있도록 상세한 분석 과정이 담겨 있는 프로토콜을 배포할 것이다.
(강좌 중 실습시간 없음; github URL 실습자료 제공).