위장관, 구강, 피부 등 인체 다양한 부위의 미생물 군집이 인간의 건강과 질병에 직접 영향을 준다는 사실이 밝혀지면서, 미생물을 질병 예방 및 진단과 치료의 맞춤의료에 활용하려는 메타지놈 연구가 빠르게 확산되고 있다. 이러한 연구의 출발점은 어떤 미생물이 어떤 비율로 존재하는지를 정확히 파악하는 것이며, 16S rRNA gene amplicon sequencing은 비용과 분석 접근성 측면에서 메타지놈 연구의 표준 진입 도구로 자리잡고 있다. 그러나 인체 유전체와 달리 메타지놈 데이터는 단일 종이 아닌 복잡한 미생물 군집을 다루므로, 분석과 해석을 위해서는 별도의 개념과 분석 기법을 익혀야 한다.본 강좌는 메타지놈 분석을 처음 접하는 수강생을 위한 기초 과정으로, 관련 논문을 읽고 이해할 수 있는 수준의 핵심 이론과 16S amplicon sequencing 기반의 실전 분석을 함께 다룬다. Day 1(사전녹화 온라인)에서는 메타지놈 연구 디자인, raw 데이터의 이해와 QC, α-/β-diversity 및 taxonomy 개념, functional inference의 핵심 이론을 정립하고, Day 2에서는 동일한 흐름을 QIIME2 프로그램을 이용한 hands-on 실습으로 직접 수행한다. 본 과정은 동일 워크샵에서 진행되는 Shotgun Metagenomics 고급 과정의 선수 지식을 자연스럽게 제공한다.

[학습 목표] 본 강의를 통하여 수강생들은 다음과 같은 기술을 익힐 수 있다.

• 메타지놈 연구 디자인과 기본 개념의 이해
  
• Marker gene (16S rRNA amplicon) 시퀀스 데이터의 품질 해석
  
• 16S raw 데이터(fastq)로부터 미생물 feature table 생성
  
• 미생물 다양성(α-diversity, β-diversity) 및 taxonomic profile 분석과 결과 해석