강좌 정보
2026 제20회 통계유전학워크샵
20th Asian Institute in Statistical Genetics and Genomics
기본 개요
강좌명
16. [단일세포전사체 응용 #2] 공간 전사체 분석
주강사
김준일 (숭실대학교), 김효빈 (고려대학교)
조교
모재우, 최휘수, 김가현, 이슬기 (숭실대학교)
날짜
2026.07.23 09:20 ~ 2026.07.24 17:10
강좌 방식
오프라인
강좌 정보
본 워크샵은 Visium 및 Xenium 등 최신 공간전사체(Spatial Transcriptomics) 플랫폼을 활용하여 조직 내 유전자 발현 패턴을 다차원적으로 해석하는 데이터 분석의 전 과정을 다룹니다. 교육 과정은 데이터 전처리를 시작으로 클러스터링, 세포 유형 주석(Annotation), 공간적 변이 유전자(SVG) 탐색, 그리고 다세포 스팟의 조성을 해독하는 디컨볼루션(Deconvolution) 분석 등 필수적인 기초 파이프라인을 체계적으로 학습합니다. 나아가 조직의 구조적 구획을 식별하는 도메인(Domain) 분석과 세포 간 상호작용 및 미세환경을 규명하는 니치(Niche) 분석, 그리고 최신 바이오 파운데이션 모델(Foundation Model)을 활용한 고도화된 분석 기법을 통합적으로 제시함으로써, 연구자들이 복잡한 생물학적 기전을 공간적 맥락에서 심도 있게 규명할 수 있는 실전 분석 역량을 배양하는 데 목적이 있습니다.
기타
인터넷 접속 필요여부
웹서핑
동영상
파일 다운로드
기타 (Google colab에서 실습)
교육생 개인 노트북
필요 필요하지 않음
세부 안내사항
16GB 이상의 RAM
수강생 수준
강좌 난이도: 중 / 수강생 수준: 생물정보학 입문자
수강생 준비물
-
기타 안내사항
-
교육일정
구분 세션 시간 강의내용 강사명 비고
Day 1 Session 1 9:20~10:40 공간전사체학의 기초 김준일 강의
Day 1 Session 2 10:50~12:30 공간전사체 기초분석 파이프라인 I (Cell segmentation, Deconvolution) 모재우 실습
Day 1 Session 3 14:00~15:20 공간전사체 분석방법과 예시 김준일 강의
Day 1 Session 4 15:30~17:10 공간전사체 기초분석 파이프라인 II (Spatial clustering, SVG, cell-cell interaction) 모재우, 최휘수 실습
Day 2 Session 5 9:20~10:40 공간전사체 응용분석 방법 김효빈 강의
Day 2 Session 6 10:50~12:30 공간전사체 응용분석 파이프라인 (CellNeighborEx, SPIX) 최휘수, 이슬기 실습
Day 2 Session 7 14:00~15:20 공간전사체 foundation model 활용 김준일 강의
Day 2 Session 8 15:30~17:10 공간전사체 foundation model 실습 최휘수, 김가현 실습